第一战区，统辖陕南、豫中地区，该战区虽名义上承担对日作战，实际重心转向监视中共根据地，豫中会战后仅控制零星区域，甚至需借第五战区驻地召开军事会议。日本投降后，胡宗南部接收豫西日军投降，战区于1947年裁撤。
司令长官 胡宗南，蒋介石心腹，黄埔学生系（胡派）首脑。其势力覆盖陕甘宁豫四省，统辖数十万兵力，号称“西北王”。
第二战区，统辖晋西南山区及陕北榆林地区，该战区依托吕梁山、太行山地形，长期坚持敌后游击战，并在豫湘桂战役后成为华北少数未被日军完全控制的战区之一。日本投降时，阎锡山主持太原受降仪式，接收日军第1军等6万余人缴械。
司令长官 阎锡山，晋绥军首领，属非嫡系实力派，名义上归属国民政府但仍保持高度自治。
第三战区，统辖浙闽山地及苏南、皖南、赣东北地区，依托仙霞岭、武夷山等复杂地形开展游击战。该战区虽在1944年浙赣战役中丢失衢州等要地，仍控制丽水、云和等山区据点，成为钉在日军华东占领区的"骨中刺"。日本投降后，该部接收杭州、宁波等城市，并于次年改组为衢州绥靖公署。
司令长官 顾祝同，蒋介石五虎上将之首，黄埔教官系（何派）二号人物。其实际影响力超越战区司令长官职务范畴，他身兼第三战区司令长官、陆军副总司令等要职，掌控苏浙闽皖四省军政大权，成为蒋介石在东南地区最信赖的代理人。
第四战区，统辖广西全境，该战区在1944年豫湘桂战役中虽丢失桂林、柳州等要地，但仍坚守桂西山区，并与美军情报组合作开展敌后破坏。后于次年改组为陆军总司令部所属第二方面军。
司令长官 张发奎，粤军核心人物之一，名义上依附于土木系。其派系因抗战整编已明显淡化，军事话语权较抗战初期显著下降。
第五战区，统辖湖北北部、安徽北部等长江以北地区，该战区在豫鄂会战中多次挫败日军西进企图，但在1945年3月老河口失守后，退守汉水以西继续游击作战。日本投降时负责接收豫西南、鄂北地区，其战略价值随抗战胜利迅速降低，1946年与第六战区合并为武汉行辕。
司令长官 刘峙（1945年2月任），蒋介石五虎上将之一，其指挥权因1945年3月老河口失守严重受损，作战部署多依赖副司令郭寄峤等实权派。
第六战区，统辖湖北长江流域，该战区历经石牌要塞保卫战等血战，成功阻滞日军溯江西进重庆的企图。日本投降后负责武汉、沙市等地受降，其"战时陪都卫戍区"的特殊职能随之终结，1946年改编为武汉行辕。
司令长官 孙蔚如（1945年7月任），杨虎城旧部，陕军后期代表人物。其任命具有政治象征意义，虽获上将衔主持武汉受降，但战区实权受土木系郭忏牵制，形成"名义统帅、实权受限"的特殊格局。
第七战区，统辖广东全境及琼崖、赣南部分区域，该战区在日军"一号作战"中虽丢失韶关，但成功保全赣粤边根据地，为后续反攻奠定基础。日本投降后负责汕头、香港地区受降，1945年12月随战时体制终结而撤销。
司令长官 余汉谋，陈济棠旧部，粤军代表人物之一。此时粤系势力已遭中央军渗透，他凭借司令长官身份重整粤北残部，勉强保持对粤军余部的实际控制权。
第八战区，统辖甘、宁、青、新地区，该战区虽无大规模战事，但依托黄河天险与六盘山防线，有效震慑日军自绥远的西犯企图，维系了中苏国际通道的安全。日本投降后，其部队迅速接管包头、归绥（今呼和浩特）等要地，完成对蒙疆驻屯军的受降监督。
司令长官 朱绍良，中央军将领，虽非黄埔嫡系，但凭借北伐战功逐渐获得蒋介石信任，成为少数能指挥中央军主力的非黄埔系将领。
第九战区，统辖江西全境，其战略地位因长衡会战失利而衰落，主要承担牵制日军第20军残部及维护粤汉铁路南段安全的任务。日本投降后，该战区参与接收长沙、衡阳等地，但受内战影响迅速被裁撤。
司令长官 薛岳，粤军代表人物之一，他凭借三次长沙会战的战功，成为蒋介石在华中地区倚重的"半嫡系"指挥官。
第十战区，统辖第一、第五战区以东（豫东南及皖北）地区，该战区实际控制大别山游击区，与第五战区形成犄角之势，日本投降后迅速被裁并为徐州绥靖公署。
司令长官 李品仙，唐生智旧部，新桂系四号人物。他在日本投降后主持皖北受降，但因派系矛盾逐渐被边缘化。
第十一战区，统辖河北全境及山东、河南部分区域，日本投降后主持平津地区受降，但不足三月即因国共冲突加剧被裁撤，成为存在时间最短的战区之一。
司令长官 孙连仲（1945年8月任），西北军老五虎之一，虽为冯玉祥旧部，但归顺蒋介石后始终获得重用，台儿庄战役后更奠定其抗日名将的地位。
第十二战区，统辖绥远、察哈尔两省全境及热河西部地区，该战区虽名义归属中央，实为傅作义晋绥系势力范围，日本投降后负责热察绥地区受降，但三个月后即因国共争夺华北而裁撤，成为存在时间最短的战区之一。
司令长官 傅作义（1945年8月任），晋绥军十三太保之一，虽出身地方军阀却深得蒋介石重用，并以绥远抗战"百灵庙大捷"奠定其抗日名将的地位。